本实用新型提供了一种控制流体定向运动的装置，包括拖板模块和安装在所述拖板模块下方的压杆模块，所述拖板模块包括拖板和驱动所述拖板进行直线运动的拖板驱动部，所述拖板驱动部与所述拖板连接，所述拖板上安装有压杆接触件，所述压杆模块包括固定板和设置在所述固定板上的压杆组件。本实用新型还提供了一种微流控芯片流体控制系统。本实用新型的有益效果是：可通过拖板模块和压杆模块配合微流控生物芯片，通过压杆模块压缩芯片上泡罩及密封流路来控制微流控芯片中流体定向运动，代替所有的人工处理样品及试剂转移过程，避免了外界污染、效率低下的问题，对全自动核酸检测分析系统的集成化、微型化和自动化发展产生了有利影响。