本实用新型公开了一种自动化污水细微颗粒收集装置，其特征在于，包括能够漂浮在污水池上的框架；所述框架中设置有用于将所述框架分隔为多个区域的分隔管；所述框架中，由所述分隔管分隔的每一个区域均悬挂一个集污袋；所述集污袋的底部具有锥形结构，采用PVC防水帆布制作而成。作为本实用新型的另一方面，还提供了一种污水细微颗粒收集系统，该系统包括上述收集装置，还包括残饵粪便收集发酵池和藻种扩培跑道池。该自动化污水细微颗粒收集装置能够有效收集粪污残渣等细微颗粒，该系统能够充分利用收集的粪污残渣，还能够使得水质得以重复利用和达标排放。上述的收集装置和系统适用于鳗鱼养殖尾水治理，也适用于富营养水体河床淤积物的抽吸治理。