本实用新型提供了一种后备制动控制系统及机车，包括第一后备制动阀、第二后备制动阀以及后备制动柜；所述后备制动柜包括：制动切换组件、中继阀以及均衡风缸；所述第一后备制动阀和所述第二后备制动阀均与制动切换组件连接；所述制动切换组件与所述均衡风缸和所述中继阀连接，所述中继阀分别与列车管和总风管连接；所述中继阀与所述列车管之间设置有遮断阀，所述遮断阀控制所述中继阀与所述列车管之间通路的导通和关闭；所述第一后备制动阀、所述第二后备制动阀以及所述制动切换组件均与所述总风管连接。本实用新型提供的后备制动控制系统，实现了后备制动控制系统的自动换端功能，操作简便，提高了后备制动控制系统的可靠性。