本实用新型公开了一种生物制药用实验瓶清洗装置，包括超声波清洗机本体，超声波清洗机本体的内腔两侧和底部均开设有凹槽，凹槽的内腔均固定连接有两个相互对侧的转动座，两侧的凹槽的内腔位于两个转动座上均转动连接有丝杆，位于右侧的丝杆纵向贯穿于超声波清洗机本体，位于右侧的丝杆的顶端固定连接有手轮，两个丝杆的底端位于凹槽的内腔均固定连接有第二锥形齿轮，位于底部的凹槽的内腔两个转动座上转动连接有连接杆，连接杆的两端均固定连接有第一锥形齿轮，且第一锥形齿轮与第二锥形齿轮啮合。本实用新型避免了在操作过程中，操作人员与清洗液发生接触，对操作人员的健康造成影响的问题，使用方便，结构简单，提高了实用性和工作效率。