本实用新型公开了一种生物制药用实验瓶清洗装置，包括固定座，所述固定座的顶部外壁固定有清洗槽，且清洗槽相对的两侧内壁均固定有弹簧，且弹簧的一侧外壁固定有夹板，且两个夹板相对的一侧外壁均粘接有防护垫，所述清洗槽的两侧外壁均开有螺纹孔，且两个螺纹孔的内壁均螺纹连接有螺纹杆，所述固定座顶部外壁的两侧均固定有固定板，且两个固定板相对的一侧外壁之间均固定有顶板，所述顶板的底部外壁固定有液压杆。本实用新型能够防止实验瓶与装置之间发生碰撞对实验瓶的瓶口造成破损，能够防止清洗机构与瓶口之间发生碰撞对瓶口造成损坏，能够防止由于晃动导致清洗机构的移动出现偏差对实验瓶的清洗造成影响。