本实用新型涉及一种便携式岩心钻机及绿色环保岩心取样系统，属于钻探设备技术领域，解决了现有钻机运输不便、岩心取样污染环境的问题。便携式岩心钻机包括固定架、转动轴、转动架、安装轴、连接杆、连接台、支撑柱、绕线轮、拉索、导向轮、安装架、钻杆、钻头、连接板和顶柱；转动架通过转动轴与固定架转动连接；安装轴设置在固定架上，安装轴上设置有用于驱动连接杆转动以使支撑柱转动的第一驱动机构；连接杆设置在连接台上；连接台设置在支撑柱上；支撑柱设置在转动架上；拉索绕过导向轮，且拉索两端分别与绕线轮和安装架连接；导向轮设置在顶柱顶部；连接板与安装架连接。本实用新型的结构简单，便于运输，绿色环保。