本实用新型公开了一种高效混料发酵系统，包括原料仓、辅料仓、预发酵仓以及发酵罐，发酵罐通过设置竖直输料管与设置于其侧面的预发酵仓连通；还包括横向输料管，原料仓、辅料仓、竖直输料管通过横向输料管连通；竖直输料管的内部设置有竖直提升绞龙；横向输料管内设置有同轴设置的第一横向输料绞龙、混料刀组、第二横向输料蛟龙，所述混合刀组设置于辅料仓底部；本实用新型使用密封的管路输料，减少了废气的散逸；绞龙结构与混料刀组配合，可充分粉碎细化物料并混匀物料；同轴设计使得输料混料同步进行，精简了设备结构，便于操控，提升工作效率，物料预发酵后再提升至发酵罐中，可有效缩短发酵周期。