本实用新型公开了一种菌种接种工作台，包括壳体，所述壳体内部开设有操作室，所述操作室底壁中间位置处固定连接有操作台，所述操作室顶壁固定连接有电动推杆，所述电动推杆输出端固定连接有支撑板，所述支撑板底端固定连接有储存箱，所述储存箱顶端远离电动推杆一侧开设有进料口，所述支撑板顶端固定连接有进料漏斗。本实用新型通过活动块、滑块、挡板、气槽、阻隔板、第一气口和第二气口的配合动作，当进行接种时，气压推动阻隔板将接种管打开，当接种完成后，气压推动阻隔板将接种管关闭，避免接种完成后仍然有菌落从接种管中滴落到操作台上，不仅污染操作台，需要工作人员清理，而且浪费菌种，增加成本。