本实用新型公开了一种蛋白质分离装置，包括主体，所述主体底部固定设置有底座，且主体上部转动设置有盖体，所述盖体顶部固定设置有加盐孔，所述加盐孔贯穿过盖体和主体内部相贯通，所述主体内部固定设置有分离罐，所述分离罐外侧固定设置有固定壁，所述固定壁内部滑动设置有可拆卸半透膜，所述半透膜与固定壁之间通过滑动卡具滑动连接，所述主体右侧底部固定设置有第一出水管，所述第一出水管端部固定连接有出水开关，所述主体左侧底部固定设置有第二出水管，所述第二出水管贯穿过主体和底座与电动阀固定连接，所述主体上部左侧固定设置有控制器。该蛋白质分离装置自动化程度高，能够有效的分离出蛋白质，并且对其进行纯化。