本实用新型提供了一种硅油集管真空密封结构，属于冻干机技术领域，包括硅油集管、箱体、法兰座、固定法兰和活套法兰，法兰座固设于箱体上，固定法兰固设于硅油集管的外侧壁周向，硅油集管贯穿法兰座，且通过固定法兰可拆卸连接在法兰座的下端，活套法兰自下而上套设在固定法兰上，且与固定法兰可拆卸连接，活套法兰侧壁的上端面抵靠在箱体的下端面上，活套法兰和固定法兰之间压装有第一密封圈，固定法兰和法兰座之间压装有第二密封圈，活套法兰与箱体之间压装有第三密封圈。本实用新型还提供了一种使用上述硅油集管真空密封结构的冻干机。本实用新型提供的硅油集管真空密封结构，大幅降低了泄露的情况，同时该结构方便拆卸维修。