本实用新型提供了一种全自动封口荧光定量PCR仪，包括PCR仪主机，PCR仪主机包括本体，本体顶部内壁安装吸附机构，本体侧壁安装工作台，本体底部靠近工作台一侧同向依次设置薄膜机构、切断机构、试管架和控制箱；工作台上设置切割孔和薄膜孔，吸附机构包括与本体顶部固定连接的基座、滚动丝杠、升降臂和真空吸盘，升降臂一端通过滚动丝杠与基座连接，升降臂另一端安装真空吸盘；薄膜机构包括与本体底部固定连接的支架，支架上端通过薄膜孔安装薄膜轮芯；切断机构包括安装在本体底部的气缸、下刀具和上刀具，气缸远离本体底部一端安装下刀具，上刀具安装在本体顶部。本实用新型结构简单，节约能源，可用薄膜自动为试管架封口。