本实用新型实时荧光定量PCR的独立荧光通道检测系统属于生物检测技术领域，包括光源、滤光器、二向色镜和光电传感模组。光源用以对检测样本发出光线，滤光器，用以筛选所述光线中特定波长的光线。二向色镜用以使所述被所述滤光器筛选过的光线被反射并通过检测样本受光线激发的荧光进行。光电传感模组用以检测发射所述荧光信号强度。通过上述方案，无需设置动态的移动组件，实现了一种荧光通道可以同时检测不同的物质发出的荧光，同时采用集成的荧光检测模块，减少物料数量，节省了加工和装配时间，维修也方便，成本更低，而且减少了各模块间的运动部件，提供了检测的精度和效率。