本申请涉及雨水综合利用系统领域，针对雨水综合利用系统中的雨水收集管容易被树叶堵塞的问题，提供了一种绿色建筑屋顶雨水综合利用系统，包括倾斜设置在屋顶边沿正下方的雨水收集槽、与雨水收集槽连通的雨水收集管、设于雨水收集管上的第一滤网、与雨水收集管连通的过滤消毒池以及与过滤消毒池连通的蓄水池，雨水收集槽与雨水收集管连通的一端开有缺口，雨水收集管靠近缺口的顶壁上设有固定轴，固定轴上设有清洗组件，清扫组件包括套设于固定轴外的轴套、固定于轴套上的若干固定板以及设于固定板上的第一毛刷，第一毛刷转至雨水收集槽内时，第一毛刷与第一滤网相抵接。本申请具有减少树叶在滤网上积聚导致雨水收集管堵塞的情况的效果。