本实用新型公开了一种环保枯草芽孢杆菌发酵用尾气除菌装置，其结构包括支撑杆、第一底座、进气管、自动清理装置、第二底座、罐体、进水口、连接件、压力表和出气管，本实用新型的一种环保枯草芽孢杆菌发酵用尾气除菌装置，为解决由于气体中含有水分，在向罐体内输送气体时，由于冷凝作用，气体中的水分会溶解部分毒素附着在进水管内壁上，从而可能导致除菌不彻底，对环境造成污染的问题，通过在支撑杆左侧面设置了自动清理装置，电机带动往复机构向右运动，往复机构带动清理机构向右运动，从而使海绵对进水管内壁进行清理工作，可以将冷凝后的水滴被海绵吸收掉，可以使除菌彻底，防止对环境造成污染。