本实用新型提供了一种电磁防护电路、真空泵控制器和真空泵系统，涉及汽车技术领域。所述电磁防护电路包括：第一电路，设置在真空泵控制器的第一输入端口和第一输出端口之间，所述第一输入端口接第一电源，所述第一输出端口接真空泵的电源输入端；第二电路，设置在真空泵控制器的第二输入端口和第二输出端口之间，所述第二输入端口接第二电源，所述第二输出端口接真空助力器的电源输入端；其中，所述第一电路和所述第二电路集成设置在所述真空泵控制器的印刷电路板上，且所述第一电路和第二电路为相同电路结构的电磁防护电路。本实用新型通过上述电路设计可以从电源处解决真空泵常转的问题。