本实用新型公开了多肽合成相关技术领域的一种用于多肽合成的搅拌器，包括搅拌桶和搅拌装置，所述搅拌装置设置在搅拌桶的上方，所述搅拌装置包括电动机、电动机固定板、增高法兰、固定环、搅拌叶和主轴，所述固定环固定安装在搅拌桶的顶部，所述固定环的顶端与增高法兰的底端固定连接，所述增高法兰的顶端与电机固定板的底端固定安装，所述电机固定板的顶板固定套接有电动机，所述电动机与主轴固定连接，所述主轴的底部分别焊接有三个搅拌叶，搅拌叶对搅拌桶内部的多肽原料试剂之间进行充分混合，所述搅拌桶包括筒体、进料口、出料口和电磁阀开关，所述电磁阀开关设置在出料口处，便于多肽原料试剂的回收。