本实用新型公开了一种种植顶板防水系统，包括钢筋混凝土顶板，所述钢筋混凝土顶板上由下至上依次设有防水层、耐根穿刺防水层、隔离层、保护层、排蓄水层、过滤层和种植土层。本实用新型的种植顶板防水系统具有优异物理阻根效果；能有效吸收钢筋混凝土顶板变形开裂产生的应力，解决了结构基层开裂而将防水层拉裂，从而导致建筑渗漏的事故发生的问题；能有效抵抗植物和土壤中的霉菌腐蚀；耐根穿刺防水层的搭接缝处辅以同材质热熔焊绳挤出焊封边，双保险搭接更牢固持久。