本实用新型公开了生物实验器械领域的一种微生物菌落隔离器皿，以解决现有技术中多个玻璃制培养皿不便于叠放的缺陷，为了解决上述问题，本技术方案包括螺纹连接的上盒盖和下盒体，所述上盒盖的表面加工有旋转对称的四个扇形凹槽，所述下盒体底面加工有与扇形凹槽形状适配的四个扇形凸起，且上盒盖的两侧边缘处都带有横截面为“一”字形的开口，所述开口内铰接有拨杆，所述拨杆以开口处的铰接点为支点，拨杆扫过的面积等于相邻两个扇形凹槽覆盖的面积，且拨杆整体扁平空心。本技术方案中利用上盒盖的扇形凹槽承接扇形凸起，实现叠放的隔离器皿堆积，便于微生物菌落隔离器皿的堆放。