本实用新型公开了一种制药废水生化处理系统，包括气浮机以及气浮机上的进水口，所述进水口的左端连通并固定有顶部为开口设置的矩形箱，且矩形箱的底部与气浮机的左侧顶部固定连接有同一个支撑座，矩形箱内设置有震动过滤机构，所述震动过滤机构包括连通并固定在矩形箱左侧的进水接管，矩形箱内活动套设有L形收集板。本实用新型设计合理，操作简便，便于在废水进入气浮机之前预先对废水中的大颗粒杂质震动过滤并集中收集，且通过震动过滤的方式能够有效避免大颗粒杂质静止沾附堵塞过滤板的现象，提高过滤效率，便于将收集的大颗粒杂质取出清理，便于快速拆卸过滤板进行清理更换，有利于使用。