本实用新型公开了一种干细胞过滤分离装置，包括分离筒和吸附壳，所述分离筒上端的开口上安装有筒盖，筒盖表面的中心处设有螺丝孔，螺丝孔中螺纹连接有密封板，螺丝孔底面的中心处设有轴孔，分离筒内部的底面上设有一凹槽，吸附壳设置于凹槽中，吸附壳内部的内壁面上安装有磁铁层，吸附壳顶面正对于轴孔处安装有轴杆，轴杆一端穿过轴孔安装于密封板的底面上，轴杆上向外凸出形成一个以上的定位部，轴孔的内壁面设有一环形结构的定位槽。本实用新型结构简单，在分层后，吸附壳能直接的进入干细胞层中，并缓慢的转动吸附壳，使得内部的干细胞能吸附在吸附壳上，避免了被堵塞，同时通过吸盘能将本装置吸附在桌面上，增加了分离时的稳定性。