本实用新型提供一种干细胞过滤分离装置，包括分离罐体和顶盖，分离罐体的顶部螺纹安装有顶盖，顶盖上设有进液口和进气管，进气管的顶端套设有进气软管，进气管延伸到分离罐体的内部，且位于分离罐体内部的进气管上设有多个出气口，进气管下方的分离罐体内设有滤网，分离罐体的两侧设有转轴，转轴通过轴承转动安装在固定架的顶端，固定架固定在底座上，分离罐体的底部设有排液管，排液管两侧的分离罐体上设有支撑套筒，支撑套筒底端的外壁处设有第一法兰板，支撑套筒内设有支撑柱，支撑柱通过弹簧与支撑套筒相连接，支撑柱底端的外壁处设有第二法兰板。本实用新型方便使用，能够提高干细胞的分离效果和效率。