本实用新型公开了一种芯轴自动钻孔装置，属于芯轴钻孔技术领域，包括装置主体，所述装置主体的一端设置有后侧板，所述后侧板远离后侧板的一端设置有前侧板，所述前侧板和后侧板相邻一端的两侧皆转动连接有导向辊，所述导向辊的外侧套设有传送带，所述传送带的外侧均匀设置有多组凹槽。本实用新型通过利用四组电动推杆带动其底部的电机和打孔针可同时对四组相邻的芯轴进行打孔，同时利用导向辊在外部驱动作用下可带动其外部的传送带转动，并使其外部的凹槽沿着传送带向右缓缓移动，从而实现对其顶部放置的芯轴进行输送，实现前四组芯轴打孔完成后，紧邻的四组未打孔的芯轴移动至打孔针的下方，并实现打孔，在一定程度上提高了工作效率。