本实用新型公开了一种植物肽分离超滤机组，包括外壳体，所述外壳体的内部固定有卷式膜元件，所述外壳体的顶部旋接固定有顶盖，所述顶盖的顶部一侧开设有进料口，所述顶盖的顶部中心处安装有电机，所述电机的输出端安装有转轴，所述转轴上安装若干个搅拌叶，所述外壳体安装在机架的顶部，所述机架的顶部一侧安装有控制板，所述外壳体的底部位于卷式膜元件的两侧对称安装有排料管，所述排料管上安装有排料阀，所述外壳体的一侧安装有清洁组件，所述控制板电性连接清洁组件和电机。本实用新型结构新颖，构思巧妙，实现植物肽混合液中的大分子多肽和小分子小肽进行快速分离，提升分离效率。