本实用新型涉及植物肽分离超滤机组除菌领域，尤其为一种植物肽分离超滤机组的除菌装置，包括机组，所述机组的顶端固定连接有分离泵机，所述机组的左侧设有定位柱，所述定位柱贯穿机组，且定位柱与机组滑动连接，所述定位柱的右侧固定连接有防护罩，本实用新型中，通过设置的紫外线灯，这种设置配合紫外线灯与防护罩的固定连接、转轴与防护罩的转动连接和定位杆与第一弹簧和连接杆的滑动连接，拉出定位杆，转动定位杆与定位柱呈水平位置，推动防护罩，经转轴转动打开防护罩呈倾斜设置，紫外线灯打开对机组内部进行除菌，倾斜设置灯光对内部照射的更加全面，避免细菌对植物肽的污染，产生额外的经济损失。