本实用新型公开了一种自助通关系统用指纹识别装置，包括外壳、盖板和空心块，所述外壳一侧开设有凹槽，且盖板滑动连接于凹槽内，所述空心块有两个，且两个空心块分别焊接于外壳顶部一对称两端，两个所述空心块之间转动连接有转杆，且转杆表面设有用于限位盖板的第一限位机构，所述外壳一侧面设有用于限位盖板的第二限位机构，且凹槽内部安装有数字键盘和指纹识别单元，所述指纹识别单元远离盖板的一侧滑动连接有活动板，所述活动板滑动连接于凹槽内部，且外壳内底部设有用于移动活动板的移动机构。本实用新型使得每个工作人员在进行指纹识别前都可准确的移动活动板，进而提高了该指纹识别装置的指纹识别效率。