本实用新型公开了一种有益微生物菌巢挤压截断成型装置，包括挤压装置，通过挤压装置将肥料挤压加工成端部未封闭且内部设有贯穿通孔的待加工肥料棒，挤压装置的出料端的一侧设有截断装置，截断装置包括机架和设于机架上用于传送待加工肥料棒的滚轮组，滚轮组由沿机架长度方向等距均匀分布的若干根滚轮组成，机架远离滚轮组的一侧设有布带传输机构，且其上位于待加工肥料棒的两侧分别通过支座连接有左驱动器和右驱动器，左驱动器的驱动杆和右驱动器的驱动杆远离支座的一端均为锥形。该装置可将待加工肥料棒加工成首尾两端均封闭且内部设有通孔的有益微生物菌巢，其适用于有益微生物菌巢的大规模生产和加工，提高了有益微生物菌巢的制作效率。