本实用新型公开了一种集成式燃料电池发动机系统，包括框架、供氢系统、燃料电池发动机、空气进气系统、水循环系统、空氢尾排系统及电气系统，框架上部安装供氢系统，中部安装燃料电池发动机、空气进气系统、电气系统、去离子器、膨胀水箱，底部安装空氢尾排系统、散热器风扇总成、电动水泵、电子节温器。本申请的集成式燃料电池发动机系统，将所包含的各个系统部件整体布置到一个框架结构上，方便系统整体吊装到整车车架上安装以及燃料电池整体调试和打包运输；整体集成化布置同时也缩短了水路、氢气路、空气路的连接管路，减少了管路内流体压力损失，进而提高了整个系统的燃料利用率及经济性。