本实用新型涉及燃料电池汽车发动机技术领域，公开了一种集成式燃料电池发动机系统，包括：集成封装壳体，以及设置在所述集成封装壳体上的电气子系统、空气子系统、水热循环子系统及氢气子系统，所述集成封装壳体包括顶壁、底壁、第一侧壁、第二侧壁及第三侧壁，所述第一侧壁与所述第二侧壁相对设置，所述第三侧壁与所述第一侧壁相邻设置；集成式燃料电池发动机系统设计可靠性高、稳定性好、系统结构紧凑，功率密度比高，零部件空间利用率高，便于发动机系统与不同车型的匹配，能够满足多款型号的整车空间布局，有利于整车的空间分配,方便零部件的更换及维护保养。