本实用新型公开了医用环氧乙烷灭菌器，包括外壳和主机，所述外壳的后侧壁上固定连接有主机，所述外壳截面呈凹形设置，所述外壳内侧均匀分布活动连接有若干个活动框，所述活动框呈中空设置。通过在外壳侧壁上开设有出气孔，并且在活动框和导管的侧壁上均开设有通孔，当使用时可以通过主机将环氧乙烷气体均匀彻底的排到设备内部，可以高效的实现灭菌操作，灭菌效率高；通过设置有活动框和导管，通过活动框和导管的作用可以将需要被灭菌的物品实现分层码放操作，避免物品之间相互挤压，便于操作使用，同时可以通过把手A的拉动方便的实现对物品的取出操作，使用方便。本实用新型具有灭菌效率高和使用方便的优点。