本实用新型涉及一种液相色谱仪在线清洗装置，包括由进样泵、四通阀、进样阀、过滤器、若干并列连接的柱单元、清洗泵以及清洗液池首尾依次连接形成的循环液路，柱单元包括依次连接的第一三通阀、色谱柱和第二三通阀，位于清洗泵和若干柱单元之间的管路上还串接有液相色谱仪和第二排液阀，进样泵的两端分别连接到四通阀和清洗液池，四通阀分别连接均带有比例阀的第一流动相瓶和第二流动相瓶，位于过滤器和若干并列连接的柱单元之间的管路上还连接带有第一排液阀的第一废液池，第二排液阀连接有第二废液池，第一三通阀和第二三通阀均为电磁三通阀，电磁三通阀和控制器电连接；本实用新型实现了在线循环清洗，无需拆卸，即可完成色谱柱的清洗工作。