本实用新型公开了一种轨道式水流量测试系统，其通过设置水位测试仪测试横杆距离水平面的高度，同时在预设横杆时，预先控制其距离沟渠底面的高度，经过以上设置，在已知到沟渠设计深度的前提下，通过横杆设置高度减去水位测试仪至水平面的高度，以此可以得到沟渠水深，在通过控制小车在沟渠内部移动，已达到所需到达沟渠流量测试的相应水深位置，通过小车上的多普勒剖面流速仪可测试单点水流速，通过单点流速测试水流量。本实用新型结构设计简单新颖，可实现对沟渠河流内部水流量的精准测量，并且本装置通过机械结构全自动控制，可避免人为因素造成的不准确性，是一种理想的轨道式水流量测试系统。