本实用新型公开了一种间距可调的菌棒输送机构，包括设有输送履带的支架，支架由左墙板和右墙板组成，左墙板和右墙板的顶面各设置有一调节板，两调节板相对的一侧分别固定有一辅助输送机构，辅助输送机构包括一罩壳、等距离设置于罩壳上的多根转轴以及弹性辅助输送带，弹性辅助输送带的外周上端还等距离设置有多个弹性限位台，本实用新型可使菌棒在输送过程中始终保持直立，等距离设置的弹性限位台保证了各菌棒之间的间距，避免各菌棒排列过松或过紧，有利于输送机构上方的机构对菌棒进行扎口和窝口；另一方面，本实用新型两调节板之间的间距可调，可适应一定范围内不同直径菌棒的输送，适用范围较广。