本实用新型提出了一种隧道式灭菌干燥机，包括外箱体、内箱体、传送托盘和传送机构；内箱体设置在外箱体内且内箱体与外箱体之间留有间距形成进风腔，外箱体上安装有进风腔连通的进风管以及与内箱体内部连通的出风管；内箱体内顶端安装有多个竖直布置并与进风腔连通的导风管；传送机构安装在内箱体内并用于传送传送托盘，传送托盘位于出风管下方，传送托盘上间隔安装有多个瓶体固定槽，多个瓶体固定槽分别与多个导风管一一对应设置。本实用新型通过传送机构传送载有药瓶的传送托盘，进风管引入热风，热风沿着导风管、进风口进入内箱体内，药瓶放置在药瓶固定槽，可避免摇晃碰撞造成不必要的损失。