本实用新型公开了一种功能性蛋白质生物改造装置，包括保护壳、循环机构和加热改造机构；加热改造机构：其包括保温箱体，所述保温箱体的左右两侧均设有排出主管和进入主管，位于保温箱体内部在排出主管和进入主管相互靠近的一端阵列分布有毛细管道，所述排出主管和进入主管相互远离的一端均设有连接机构，位于毛细管道的上下两侧在保温箱体的内部侧面设有两个加热网；循环机构：其包括液压泵，所述液压泵的输出端设有循坏管道二，所述循坏管道二的另一端与进入主管的侧面连接，该功能性蛋白质生物改造装置，可以避免蛋白质直接加热发生损坏，便于使用者的使用，而且可以对蛋白质循坏加热，防止造成蛋白质改造不充分。