本实用新型提供了一种养殖尾水生态处理系统，涉及水产养殖技术领域，主要目的是提供一种水产养殖尾水处理装置，避免养殖过程中产生的尾水对环境造成污染。该养殖尾水生态处理系统，包括用于进行水产养殖的养殖池、用于去除所述养殖池内产生的固体沉淀物的沉淀池和用于处理所述养殖池悬浮物的过滤系统，其中：位于所述养殖池内的养殖尾水经回水管道输送至所述沉淀池内，位于所述沉淀池内的尾水经沉淀处理后，液态污物流入所述过滤系统内；所述过滤系统包括微滤机和蛋白分离器，液态污物依次经所述微滤机和蛋白分离器处理后得到的液态污水能经排水口排出。本实用新型能提供一种具有较好的尾水处理能力的系统，以得到能够循环利用的养殖尾水。