本实用新型涉及一种修复有机污染土壤和地下水的箱式原位注入系统，包括配药罐和药剂分配单元，药剂分配单元包括并联的多个输药支管，各输药支管上均设有流量调节阀，多个输药支管通过一个输药总管连接配药罐的药剂出口，输药总管上设有药剂输送泵，药剂分配单元设于箱子内或平板上，箱子或平板的底面上设有滚轮，配药罐和所述输药总管的一部分设于集装箱内。本实用新型可实现单一或多个注入井的药剂针对性注入，可实现药剂注入量的精确调控，药剂分配单元既可置于集装箱内，也可置于集装箱外临近注入井处，并可在小范围内灵活移动，特别适合小范围污染场地修复、科研机构开展技术研发以及污染治理项目的现场中试试验，实现污染定向去除。