本实用新型公开了一种种子加工用的灭菌装置，包括架体，所述架体的侧面安装有水箱，所述水箱内设置有杀菌液，所述水箱的顶部连通有水管，所述水管贯穿架体的侧面并连通有喷头，所述喷头固定在架体的内部的顶部。本实用新型中喷头将杀菌液喷出对滚筒内的种子进行灭菌杀毒，每颗种子都能在搅拌齿的搅拌下与杀菌液接触，其杀菌面积全面，杀菌效果好，有效避免了位于内部种子杀菌效果不好的问题，提高了种子的杀菌效果和后期种子的种植质量，过滤箱内的过滤网将待杀菌的种子种的杂质过滤，可节省大量的杀菌液，风机将电热丝产生的热量通过筛孔吹入到滚筒内，对种子进行干燥，提高了种子的储存时间。