本实用新型涉及种子灭菌技术领域，具体的说是一种农业种子加工用灭菌箱，包括灭菌箱主体，所述灭菌箱的内部滑动安装有多个可抽拉的存放框，所述存放框活动插接在由支撑杆与侧板、抽拉板组成的框架内侧，所述抽拉板远离灭菌箱主体的一侧外壁上与L形结构连接杆的一端固定连接，所述连接杆的另一端活动插接在外管的内部，所述外管为U形结构在灭菌箱主体的外壁上阵列分布有多个，所述外管的数量与存放框相等，所述外管远离抽拉板的一端固定连接转接盒，所述转接盒竖直安装在灭菌箱主体的背部，所述灭菌箱主体的背面还固定安装有多个与外管数量相同的驱动电机。该农业种子加工用灭菌箱，保证种子在灭菌处理时的完整性，减少损坏率，可广泛推广。