本实用新型揭露了一种在线清洗消毒的纯化水机，其包括原水箱、原水泵、预处理单元、中间水箱、增压泵、换热器、一级反渗透单元、二级反渗透单元以及EDI单元，所述一级反渗透单元的出水端还设有与所述中间水箱进水端连接的第一管路，所述中间水箱、所述增压泵、所述换热器以及所述一级反渗透单元通过所述第一管路形成第一回路，所述二级反渗透单元的出水端还设有与所述中间水箱进水端连接的第二管路，所述中间水箱、所述增压泵、所述换热器、所述一级反渗透单元以及所述二级反渗透单元通过所述第二管路形成第二回路。本实用新型实现了对纯化水机的各个单元进行单独的在线清洗消毒；同时提高了增压泵的使用寿命；此外也保证反渗透单元和EDI单元有稳定的进水。