本申请为一种制剂用纯化水机微酸消毒系统，属于管道消毒领域，包括供水系统、微酸电解水机，微酸电解水机通过第一杀菌管道连接于纯水箱与供水管道的出水端之间，对应微酸电解水机与纯水箱之间的第一杀菌管道上还连接有增压装置，增压装置将微酸电解水机产生的微酸泵入纯水箱；第二杀菌管道连接于纯水箱、预处理单元和第一处理单元之间的供水管道之间；第一开关阀设置于第二杀菌管道的靠近纯水箱的位置；上述微酸电解水机将纯水电解为微酸性水，使得微酸性水在整个供水系统中循环，对供水系统进行周期性杀菌，既不用提前进行人工配比，也不用在消毒后反复的冲洗，减少水的浪费，同时也无残留，减少对人体的伤害；另外也不会存在臭氧难闻的气味。