本实用新型公开了一种空瓶自动分拣结构，包括安装台、推瓶板和挤瓶板，所述安装台下方设置有支撑腿，且安装台上方设置有支撑架，所述安装台右侧上方设置有支架，所述底座为圆形结构，所述安装台右侧上方设置有空瓶收集槽，且空瓶收集槽为拆卸结构。该空瓶自动分拣结构，结构设置合理，驱动电机带动转盘转动，在转盘带着药瓶进入推瓶杆下方对应位置时，当重量感应器检测到的重量小于预设值时，气缸带动活塞杆向转盘边缘运动，推瓶板将药瓶推入到空瓶收集槽，当重量感应器检测到的重量大于预设值时，药瓶随着转盘继续运动，挤瓶板将药瓶挤入排瓶斗中，从而将装有药丸的药瓶送入下个工序，能够更好的保证药物的安全生产，促进药物行业的发展。