本实用新型公开了一种生物生态水处理系统，包括排污管、初级处理池和次级处理池，所述初级处理池与次级处理池并列设置，初级处理池顶端具备两个连通至地面的排渣井，所述排污管通过安装有蝶阀的分支管分别连接至排渣井顶侧；所述排渣井内在分支管出口下方均悬挂有滤笼，且在初级处理池上方安装有起吊设备用于悬挂滤笼，所述滤笼包括上部的刚性支撑环和下部连接的网兜组成；所述初级处理池内安装有泥膜生物反应组件，底端铺设有过滤层，所述过滤层底侧开口与次级处理池连通，所述次级处理池表面设净化植物群落，内部为清洁型生物群落。本实用新型处理污水的同时可创造一定效益，而且对于垃圾量大的污水过滤能力高，而且垃圾容易分离。