本实用新型公开了一种水稻种子制种脱粒清粮装置，属于水稻清粮技术领域，其包括电机，所述电机的输出端与动力轴的一端固定连接，所述动力轴的另一端固定连接有驱动块，所述驱动块的左侧面与限位槽内壁的右侧面搭接，所述限位槽开设在震动箱的右侧面，所述震动箱的上表面固定连接有两个滑块，所述滑块滑动连接在第一滑槽内，所述第一滑槽开设在装置壳体的下表面。该水稻种子制种脱粒清粮装置，通过设置电机和搅拌轮，通过开启电机令震动箱反复进行左右移动，同时令主动轮带动搅拌轮旋转并对种子进行初步的去皮，使得该清粮装置可以通过震动箱和搅拌轮之间的相互配合对水稻种子进行快速且有效的筛分，提高了筛分的效率。