一种基于环保的用于过滤膜截留物的清理装置，包括下壳体、上壳体，进水管、以及出水管，过滤装置，保护机构，搅拌机构，以及排污机构。每个所述过滤装置皆包括限位架，以及过滤件。所述保护机构包括卡槽，以及隔离装置。每个所述卡槽皆包括卡槽主体，以及限位块。每个所述隔离装置皆包括隔离架，隔离板，连接板，以及丝杆升降装置。所述隔离板包括隔离板主体，以及限位槽。每个所述搅拌机构皆包括搅拌杆，以及电机。每个所述排污机构皆包括排污管，以及电磁阀。所述隔离装置分别设置在两个所述过滤装置的两侧，以使所述保护机构对所述过滤装置进行保护。该基于环保的用于过滤膜截留物的清理装置保护了过滤件，使截留物充分清理。