本实用新型公开了一种纯化水灭菌装置，包括筒体与两个腔室，两个所述腔室在筒体内，两个所述腔室底部相通，每个所述腔室内均固定连接有管套，所述管套内套接有紫外线灯管，所述管套远离筒体的一端固定连接有固定块，其中一个所述固定块上设有驱动部件，驱动部件包括转动轴，所述转动轴上固定连接有叶片，所述叶片两端均固定连接有拨动片，所述转动轴穿过筒体固定连接有第二皮带轮，两个所述腔室之间设有清理部件，本实用新型能够加大紫外线灯管对纯化水等光照时间，从而充分的进行灭菌的同时，能够自动清理保护紫外线灯管的管套，来达到紫外线应该有的穿透性，从而不受管套上残渣的影响。