本实用新型公开了一种自体脂肪干细胞预处理系统。所述自体脂肪干细胞预处理系统包括第一容置箱体，其具有第一容腔；第二容置箱体，其具有第二容腔；第三容置箱体，其包括第三顶板、第三底板以及第三周侧板，第三顶板、第三底板以及第三周侧板围合形成一个第三容腔；旋转装置，旋转装置能够带动第三容置箱体的除第三顶板外的其他部分旋转。本申请的自体脂肪干细胞预处理系统在处理脂肪干细胞时不需要脂肪组织暴露在其他环境中，不会由于使用者的误操作或者来回转移导致提取失败。