本实用新型公开了一种生物制剂用发酵装置，涉及发酵技术领域。本实用新型包括保护外壳，保护外壳的中间位置开设有加工腔，保护外壳的外侧且位于加工腔的外侧开设有制冷腔，保护外壳的上端固定有电机，电机的输出端贯穿保护外壳卡接有传动轴，传动轴的外侧且位于加工腔的内部卡接有涡轮片，传动轴的一端且位于涡轮片的外侧卡接有清扫板，且清扫板和加工腔的内壁过渡配合。本实用新型通过启动储液箱对加工腔内部的原料进行降温，使原料的粘性有效的降低，从而能够将加工腔的内壁清理的更加干净，通过将废弃排入储液箱的内部，对废气进行过滤，从而能够有效的避免废气直接排放到空气中，对大气造成污染。