本实用新型公开了一种检测液滴光学检测单元系统，包括底座，所述底座顶部的一侧固定连接有支撑柱，所述支撑柱的外壁滑动连接有升降滑套，所述升降滑套的一端固定连接有连接柱，所述连接柱远离升降滑套的一端固定连接有观测器，所述观测器顶部的一侧设置有目镜；所述观测器底部的一侧安装有卤素灯，所述观测器的底部远离卤素灯的一侧设置有物镜；所述观测器顶部的中心设置有光学平台，所述光学平台的一侧安装有激光发射器。本实用新型中，该种检测液滴光学检测单元系统通过将液滴从芯片一端插入光学平台进入，即可通过光学系统检测出液滴中的荧光量，然后即可根据荧光量反推液滴中的对应待测物质的核酸含量，工作效率大大提高，值得大力推广。