本实用新型公开了一种基于虹膜识别的医疗信息识别系统，包括挂号缴费终端和报告终端，所述挂号缴费终端和报告终端均内置虹膜采集单元；还包括信号输送模块、处理器、数据库、云服务器、报警模块和监控终端；所述挂号缴费终端和报告终端通过信号输送模块与处理器电性连接，所述处理器分别与数据库、云服务器、报警模块电性连接，所述报警模块与监控终端电性连接。本实用新型无需采用传统的物理介质，不仅减少就医成本，同时也提高了工作效率，通过配合各种自助终端，大大减少了患者就诊时间，减少了安全隐患，从而也减少了医患纠纷发生的可能，本实用新型有利于医院的信息化建设，改善医疗卫生服务，改进医疗服务流程，利于大面积推广使用。