一种水资源智能数据采集系统，包括驱动机构和取样机构；驱动机构包括第一电机，第一电机的输出轴上绕设有第一钢绳，第一钢绳固定连接有重锤，重锤固定连接有第二钢绳；取样机构包括与第二钢绳固定连接的第二电机，第二电机的外壳通过多个连接杆固定连接有基体，基体上穿设有取样管，基体内部开设有多个沿取样管的圆周方向均匀分布的样本腔，样本腔中设置有传感器，基体转动连接有套筒，套筒的上端封闭并且与第二电机的输出轴固定连接，套筒的上端开设有出气孔，取样管伸入到套筒中，套筒的筒壁上开设有一个进水孔，进水孔与其中一个样本腔相连通。本实用新型能够在一次取样过程中得到多份深度不同的水资源样本，能够得到更加丰富的水资源数据。